To κτήριο του Δημοτικού Σχολείου Αγκαθιάς-Κυψέλης, βρίσκεται σε οικόπεδο 2.793 τ.μ. , στον κεντρικό δρόμο του χωριού Αγκαθιά Ημαθίας, απέναντι από την πλατεία, και έχει έκταση 570 τ.μ.
Tο αρχικό κτήριο ανεγέρθηκε το 1940, είχε τρεις αίθουσες διδασκαλίας και ένα γραφείο, ενώ το πάτωμα του ήταν φτιαγμένο από σανίδες και γκρο-μπετό.
Το 1962 προστέθηκαν και άλλες δύο αίθουσες διδασκαλίας, ενώ το πάτωμα καλύφθηκε εξ ολοκλήρου από μωσαϊκό.
Το 1978 εντός του οικοπέδου ανεγέρθηκε δευτερεύoν διώροφο κτήριο, συνολικής έκτασης 256τ.μ., αποτελούμενο από κυλικείο, ισόγειο και έναν όροφο με δύο αίθουσες διδασκαλίας, το οποίο σήμερα δε χρησιμοποιείται καθόσον δεν είναι λειτουργικό.
Το 1999 προστέθηκαν στο ήδη υπάρχον αρχικό σχολικό κτήριο και άλλες δύο αίθουσες διδασκαλίας, ένα γραφείο, κυλικείο και τουαλέτες.
Το 2002 πραγματοποιήθηκε ανάπλαση του χώρου της αυλής, με πλακόστρωση.
Σήμερα, το σχολείο αποτελείται από επτά (7) λειτουργικές αίθουσες διδασκαλίας, εκ των οποίων η μία (1) λειτουργεί ως Αίθουσα Πληροφορικής, ένα (1) γραφείο διδασκόντων, το παλιό κυλικείο, το οποίο έχει μετατραπεί σε χώρο του Τμήματος Ένταξης, τουαλέτες και λεβητοστάσιο.
